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Dans les laboratoires de microbiologie clinique, l'identification microbienne est traditionnellement réalisée ‘par des analyses phénotypiques et biochimiques, ce qui prend de quelques heures à plusieurs jours selon l'espèce microbienne. La technologie de la spectrométrie de masse MALDI-TOF permet de générer des empreintes spectrales de masse uniques des micro-organismes, qui sont principalement un instantané des protéines ribosomales, idéal pour une identification microbienne précise au niveau de l'espèce. [1] La spectrométrie de masse MALDI-TOF peut identifier rapidement et précisément une large gamme de micro-organismes à un coût raisonnable en utilisant seulement une partie ou la totalité de la colonie et une goutte de solution de matrice.[2,3] La capacité de la spectrométrie de masse MALDI-TOF à identifier directement les bactéries dans les hémocultures positives est également importante pour la gestion efficace des infections sanguines. [4,5]
*MSA04, MSA05 will release in 2022.
La matrice CHCA pour AUTOF MS est utilisée pour l'identification des bactéries et des champignons (à l'exception des champignons filamenteux) avec MALDI TOF MS. La matrice CHCA peut adsorber l'énergie laser et transférer l'énergie à la protéine microbienne pour créer des ions. Ensuite, ces ions peuvent être détectés par le détecteur MALDI TOF MS, ce qui permet d'identifier l'espèce microbienne.
Le Calibrateur pour AUTOF MS est un réactif utilisé pour la calibration de l’AUTOF MS. Le calibrateur comprend la ribonucléase, la myoglobine et les protéines extraites d’E.coli, qui présentent des pics peptidiques et protéiques typiques dans le MALDI TOF MS.
Le réactif de prétraitement d’échantillon est utilisé pour le prétraitement des bactéries, des champignons et des échantillons d'hémoculture positifs lors de l'identification avec MALDI TOF MS. Le lysat 1 et le lysat 2 sont utilisés pour détruire la paroi cellulaire de l'échantillon et extraire la protéine ribosomale. La solution de matrice de 1 µl est ajouté à la position avec la protéine extraite pour générer le cristal.
Le kit de prétraitement MS AUTOF (échantillons d'hémoculture) est un réactif utilisé pour le prétraitement des micro-organismes en milieu de culture avant leur identification. Le réactif décompose les cellules sanguines de l'hémoculture positive pour séparer et enrichir les micro-organismes, afin d' acquérir des protéines de bactéries pathogènes pour l'analyse par AUTOF MS.
Le kit de prétraitement MS AUTOF (champignons filamenteux) est un réactif utilisé pour le prétraitement des champignons filamenteux lors de l'identification à l’aide de MALDI TOF MS. Le réactif décompose les parois cellulaires des champignons filamenteux afin de libérer les protéines pour l'analyse par AUTOF MS.
La plaque d’échantillon ciblé du système automatisé d'identification microbienne par spectrométrie de masse (ci-après « plaque d'échantillon ciblé ») est composée d'une lame cible et d'un support de lame cible. La plaque d'échantillon ciblé est destinée à porter l'échantillon au cours de prétraitement et d'identification du système automatisé d'identification microbienne par spectrométrie de masse
1. A. Croxatto, G. Prod’hom, et G. Greub, « Applications de la spectrométrie de masse MALDI-TOF dans la microbiologie de diagnostic clinique », Avis sur la microbiologie FEMS, vol. 36, no. 2, pp. 380-407, 2012.
2. M.A. Claydon, S.N. Davey, V. Edwards-Jines, et D. B. Gordon, « Identification rapide de microorganismes intacts à l'aide de la spectrométrie de masse », Nature Biotechnology, vol. 14, no. 11, pp. 1584-1586, 1996.
3. R. D. Holland, J. G. Wilkes, F. Rafii et al., « Identification rapide de bactéries entières intactes basée sur des modèles spectraux par désorption/ionisation laser assistée par matrice avec spectrométrie de masse à temps de vol, » Communications rapides en spectrométrie de masse, vol. 10, no. 10, pp. 1227-1232, 1996.
4. M. Drancourt, « Détection de micro-organismes dans des échantillons de sang à l'aide de la spectrométrie de masse à temps de vol par ionisation par désorption laser assistée par matrice : une critique », Microbiologie clinique et infection, vol. 16, no. 11, pp. 1620-1625, 2010.
5. Y. Hoyos-Mallecot, C. Riazzo, C. Miranda-Casas, M. Rojo Martín, J. Gutiérrez-Fernández, et J. Navarro-Marí, « Détection et identification rapides des souches porteuses de carbapénémases directement à partir d'une hémoculture positive à l'aide de MALDI-TOF MS », Journal de la méthode microbiologique, vol. 105, pp. 98-101, 2014.
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